Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt78E9Q0F0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt78E9Q0F0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt78E9Q0F0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt78E9Q0F0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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