Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm3298E9PW80 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3298E9PW80 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3298E9PW80 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3298E9PW80 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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