Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smok3bC0HKC9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms