Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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