Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms