Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms