Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms