Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms