Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Trabd2bB1ATG9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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