Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms