Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf2A3KGV1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf2A3KGV1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms