Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atp8b5A3FIN4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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