Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms