Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms