Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms