Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms