Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptpn4Q9WU22 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms