Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a4Q9QZR9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms