Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc1Q9QZF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms