Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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