Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms