Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms