Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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