Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms