Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gde1Q9JL56 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gde1Q9JL56 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms