Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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Rb1cc1Q9ESK9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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