Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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