Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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