Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms