Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Csnk1dQ9DC28 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk1dQ9DC28 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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