Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Syde1Q9DBZ9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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