Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms