Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tysnd1Q9DBA6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms