Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim23Q9DAL0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim23Q9DAL0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms