Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms