Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tmigd1Q9D7L8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tmigd1Q9D7L8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmigd1Q9D7L8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmigd1Q9D7L8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmigd1Q9D7L8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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