Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms