Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms