Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pramef12Q9D2F1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pramef12Q9D2F1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pramef12Q9D2F1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef12Q9D2F1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef12Q9D2F1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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