Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms