Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms