Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms