Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms