Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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