Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Malsu1Q9CWV0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms