Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms