Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1lQ9CWB5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms