Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms