Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sft2d3Q9CSV6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sft2d3Q9CSV6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sft2d3Q9CSV6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sft2d3Q9CSV6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sft2d3Q9CSV6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sft2d3Q9CSV6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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