Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms